Debilitada tras reconstruir el mundo, la diosa se transformó en árbol y se sumió en un profundo sueño. Sin embargo, las fuerzas del mal se pusieron en marcha para liberar a los Benevodons y así conquistar el mundo. Como parte de su plan, desencadenaron una terrible guerra con el fin de desestabilizar los distintos reinos.
La paz había tocado a su fin. El maná empezó a desvanecerse y el árbol de Mana comenzó a marchitarse…
TRIALS of MANA es la versión renovada en HD de la tercera entrega de la serie Mana, que salió a la venta originalmente en Japón con el título "Seiken Densetsu 3". El juego se ha reconstruido por completo con gráficos 3D de última generación.